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Arp Schnitger hatte spätestens seit seiner Heirat 1684 enge Beziehungen nach Neuenfelde. Nachdem dort die neue Kirche St.Pankratius errichtet worden war, erhielt er den Auftrag für eine neue Orgel. Vorerst sollte er aber noch die alte Orgel wieder aufstellen. Weil die Ausmalung der Kirche noch einige Zeit in Anspruch nahm, konnte die Fertigstellung seines Instruments erst 1688 erfolgen.
Die Orgel in Neuenfelde gehört zusammen mit der in Estebrügge zu den größten zweimanualigen Werken Schnitgers.
Im 19. Jahrhundert fand ein Umbau entsprechend des Zeitgeschmacks statt, der aber nicht so folgenschwer ausfiel, wie in anderen Orten.
Die schnitgerschen Verhältnisse wurden im 20. Jahrhundert wiederhergestellt. Der bisherige Zustand war zwar befriedigend, eine Restaurierung nach den heutigen Erkenntnissen und Möglichkeiten wird jedoch angestrebt. Inzwischen wurde entschieden, dass die Werkstatt Wegscheider die Restaurierung ausführen wird.  Aktuelle Informationen unter www.schnitgerorgel.de

1750 Dispositionsänderung durch Jacob Albrecht, Lamstedt
Krummhorn 8 aus dem Ow ins Rp statt Trichterregal 8, im Ow eine neue Vox humana 8
1867 Umbau durch Johann Hinrich Röver, Stade
Stilllegung des Rückpositivs. Neues Hinterwerk, unter Einbeziehung von Gedackt 8 und Blockflöte 4 von Schnitger, 3 Register bleiben im Rp
1886 Weitere Änderungen durch den Sohn Heinrich Röver
Er ersetzt weitere Register (nicht ganz geklärt): Mixtur und Cymbel in OW, Mixtur und Cornet im Pedal.
1926 Erste Restaurierung durch Hans Henny Jahn, Hamburg und Karl Kemper, Lübeck
Das Rp wird wieder hergestellt. Fehlende Schnitgerpfeifen werden durch Bestände von Kemper aufgefüllt.
1938 Erneuerung fast aller Mixturen und Zungen durch Paul Ott
1951 Beseitigung von Feuchtigkeitschäden, Änderung der Spieltraktur und neue Vox humana im Hw, nach dem Vorbild St.Jacobi in Hamburg, durch Rudolf von Beckerath
1955 Herabsetzung des Winddrucks und Intonation durch Paul Ott
1978 Abschluß einer längeren Restaurierungsphase durch Paul Ott
Windladen abgedichtet, Pfeifen repariert, Trakturänderungen von 1951 rückgangig gemacht,
alte Balganlage reaktiviert

  Schnitger:   Gehäuse, Prospektprinzipale, Register, Windladen, Manualklaviaturen, 6 Keilbälge